一区，影响因子：9.
从营养生长到生殖生长的过程对于棉花的早熟非常重要。然而，这种高度动态和复杂的发育过程的遗传控制仍不清楚。使用两个早熟和晚熟棉花品种的72个样本，从六个发育阶段生成高分辨率的组织和阶段特异性转录组谱。石蜡切片的组织学分析结果表明，早熟品种的花芽分化发生在真叶第三期（3TLS），晚熟品种的花芽分化发生在真叶第五期（5TLS）。采用两两比较和加权基因共表达网络分析，得到个差异表达基因，分为10个基因共表达模块。在MElightcyan模块中，鉴定出46个调控棉花花芽分化的候选基因，并在花芽分化阶段表达。在MElightcyan模块中鉴定了一个与花芽分化相关的新的关键调控基因GhCAL。Anti-GhCAL转基因棉花植物表现出晚花芽分化和开花时间。GhCAL与GhAP1-A04/GhAGL6-D09形成异二聚体并调节GhAP1-A04和GhAGL6-D09的表达。GhAP1-A04-和GhAGL6-D09-沉默的植物也显示出显着的晚开花。最后，我们提出了一种由GhCAL介导的新开花调控途径。本研究阐明了棉花开花调控的分子机制，为棉花早熟育种提供了良好的遗传资源。
材料和方法1.植物材料和样品采集
早熟陆地棉品种CCRI50、Yanzao2和晚熟品种Guoxinmian11、STS。收集了六个阶段的茎尖：子叶阶段（0TLS），第一真叶阶段（1TLS），第二真叶阶段（2TLS），第三真叶阶段（3TLS），第四真叶阶段（4TLS）和第五个真叶阶段（5TLS）。对于每个阶段，对于三个生物重复中的每一个，将10-15个棉苗的茎尖汇集在一起，用于RNA提取。将这些样品立即放入液氮中并储存在80°C的冰箱中。
2.茎尖的解剖观察
在本研究中，在每个阶段的3个生物重复中，为了保持样品完整，每个阶段都轻轻地切除3~5个棉花幼苗的茎尖。处理—染色。在日本OlympusSZ61TR光学显微镜下观察棉花花芽分化过程，记录并拍摄各时期的分化日期和形态特征。
3.RNA提取测序
测序平台IlluminaHiSeq双端bp。
4.比对分析
TM-1参考基因组(Gossypiumhirsutum,ZJU)。从
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