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乐备实分享单细胞空间蛋白检测追踪个体化

来源:石蜡 时间:2024/1/12

空间生物学的力量在于能够整合从单细胞/亚细胞到组织尺度的多组学信息。长久以来,对组织中蛋白质生物标志物的空间分析还大多使用传统的IHC或荧光法,单次运行往往仅能分析几个或十几个靶标。CosMx?单细胞空间分子成像系统(CosMx?SMI)是一种在分辨率上实现突破性创新的原位检测技术,它结合了超高分辨率成像和超多靶标的检测能力,能够对组织切片中多种蛋白质进行精细的单细胞空间定位和精准的表达定量分析。CosMx?SMI能够广泛兼容福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)、新鲜冷冻(FF)、组织芯片(TMA)和类器官等组织类型,尤其是临床应用当中广泛使用的FFPE样本,其中的核酸和蛋白质往往存在不同程度的损伤和片段化导致样本质量很低。NanoString研发团队也将NanoString近20年的表达探针设计开发经验用于CosMx?SMI的Panel研发,并针对FFPE样本进行了严谨的设计验证和流程优化,可直接应用于标准玻片上的FFPE和新鲜冷冻组织。近期,CosMx?SMI的种RNA检测方案也正式上线,以领先的超高覆盖度为您提供前所未有的生物学洞察力!

在该项研究中,研究人员使用CosMx?蛋白检测方案探索了SMMART(SerialMeasurementsofMolecularandArchitecturalResponsetoTherapy)临床试验项目中多种癌症类型的样本。(这项研究是在阿斯利康制药公司的支持下进行的。)

利用CosMx?SMI,研究人员可以在单细胞的高分辨率水平下实现对超多蛋白质的表达检测,从而实现了对病人的转移性肿瘤在接受个体化治疗过程中的组织空间迁移痕迹的追踪和机制分析。其中对磷酸化蛋白的检测还可以分析激酶抑制剂疗法对活检样本组织空间微环境的影响。对治疗压力下纵向转移性乳腺癌活检样本中的多种蛋白质进行空间分析,为了解肿瘤的演变以及开发能够直接针对肿瘤细胞的治疗方法提供了独特的新机会。

在“NanoString生物技术”

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