从采集各种水质的水样到分析测定，要经过一定的时间。变化，微生物代谢活动和化学作用的影响，会导致水样的一些物理参数和化学成分发生变化，导致水质检测结果不准确。为了将这些变化降低到很低的水平，需要尽可能缩短运输时间，尽快分析测量，采取必要的防护措施；有些项目必须在采样点进行测量。
(1)水样的运输
采集的每份水样都应记录下来，在采样瓶上贴上标签，然后运送到实验室。在运输过程中，请注意以下几点：
1、拧紧取样容器口的塞子，必要时用密封胶和石蜡密封（试油的水样不能用石蜡密封）。
2、为避免水样在运输过程中因震动、碰撞而造成损失或污染，最好将样品瓶包装好，用泡沫塑料或纸条将其压紧。
3、需要冷藏的样品应配备专用的保温容器，将制冷剂放入其中，并将样品瓶放入其中。
4、冬季应采取保温措施，避免样品瓶冻裂。
(2)水样的储存
储存水样的容器可能会吸附待测成分或污染水样，因此请选择性能稳定、杂质含量低的材料制成的容器。常用的容器材料有硼硅玻璃、石英、聚乙烯和聚四氟乙烯。其中，石英和聚四氟乙烯杂质含量低，但价格昂贵。通常，由聚乙烯和硼硅酸盐玻璃制成的容器广泛用于日常监测。对于不能及时运输或不能尽快分析的水样，应根据不同监测项目的要求，采取适当的保存方法。水样的运输时间通常以24小时为最长允许时间。
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