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高通量测序组织样本的处理FFPE

来源:石蜡 时间:2022/6/3
我们对癌症、肿瘤检测通常都是用的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本。这个样本主要是经过医生手术切除和活检等得到的组织样本,然后用甲醛溶液来处理组织样本,就得到了我们想要的FFPE样本。FFPE处理的样本有优点,也有缺点。先说优点:1、经过FFPE处理过的样本可在室温保存数年以上。2、再通过切片和染色也易于观察,并且在临床上多使用此法。缺点:虽然其可以通过固定蛋白来保持很好的细胞形态,但是也会造成各种DNA交联、碱基C变成T、或者糖苷键水解导致末端碱基丢失,以及DNA核酸片段化等。但是对于他的缺点也有一些方法对其优化,避免FFPE标本检测结果的影响。例如:1、提取时充分高温,就可以有效的减少DNA交联,并提高DNA的产量。2、PCR前可以使用UDG处理,能有效的减少60%-80%的C:GT:A的假突变等。预览时标签不可点收录于合集#个上一篇下一篇 转载请注明:http://www.0431gb208.com/sjszlfa/480.html