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如何从FFPE样本中获得高质量的RNA石

来源:石蜡 时间:2022/5/9

在如何获取高质量RNA,我们了解了取材影响和样本处理两个环节。当FFPE样本制备完成,首次使用后可以保存以备后续使用,而保存条件是否合适也是影响核酸质量的一个重要因素。保存条件主要涉及两个方面:温度和时间。今天我们先讨论下保存温度对样本核酸质量的影响。

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保存温度

有些观点认为FFPE样本制备过程中历经了固定、脱水、透明、浸蜡包埋等一系列流程后,其中所含的各种酶类活性早已经丧失,所以一旦样本制备完成,RNA质量便不会发生太大改变,但科学实验证明事实并非如此。

如下图1所示,取自不同部位组织(脾、脑、心脏)制备的FFPE样本,分别在4℃、室温、37℃条件下保存一年,一年后发现其中的RNA与立即提取时相比,出现了不同程度的降解,并且保存的温度越高,样本降解程度越严重。因此建议制备好的FFPE样本若需长时间保存,应选择低温保存条件(4℃)以减少RNA降解,从而确保在下次使用时仍可以提取获得高质量的RNA。

图1不同保存温度对FFPE样本中RNA质量的影响

参考文献

[1]SilkevonAhlfen1,AndreasMissel,KlausBendrat,et.DeterminantsofRNAQualityfromFFPESamplesPLoSONE2(12):e.

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