年12月底,在中国首次从非典型肺炎住院患者采集的样本中分离出冠状病毒(COVID-19)。
分子进化分析表明,SARS-CoV-2可能来自蝙蝠宿主,是一种有能力的人类病原体,尽管最初的溢出机制是一个持续争论的主题。虽然SARS-CoV-2出现的时间轴尚未确定,但进化分析预测,在12月武汉首次记录疫情之前,该病毒可能在世界范围传播了一段时间,甚至几个月。
到年1月中旬,北美和欧洲记录了亚洲以外的病例。意大利是第一个报告持续社区传播SARS-CoV-2的欧洲国家,此前于年2月20日在伦巴第的科多尼奥发现了一例与旅行无关的病例。意大利迅速成为欧洲疫情的中心,伦巴第是受影响最严重的地区。主导伦巴第疫情并随后传播至欧洲和其他地区的病毒株与参考基因组(武汉发现的第一株)不同,因为同时存在几种突变,包括CT(同义)、CT(RdRpPL)和AG(SpikeDG)。该菌株现在在NextStrain和穿山甲B.1中被归类为20A,具有αβ突变特征,也被称为DG单倍型。
几条证据表明,SARS-CoV-2在被识别之前已经在不为人知的情况下传播了一段时间。
事实上,年12月下旬在意大利北部、年11月25日在巴西的废水中检测到了SARS-CoV-2RNA。
年12月,在一名因咯血住院的法国患者的呼吸道样本、米兰(伦巴第)一名疑似疑似患者的口咽拭子和因急性循环功能不全而死亡的一名患者的血液和肺部中均检测到新冠病毒RNA;在意大利米兰患有皮肤病的女性的石蜡包埋皮肤活检中检测到了新冠病毒和抗原,而该样本的采样时间为年11月。
据报道,感染SARS-CoV-2的患者会出现多种皮肤表现,这在伦巴第也经常观察到。这些表现在COVID-的背景下造成诊断困难,可能出现在任何疾病阶段,尽管它们通常以迟发为特征,并且具有可变的持续时间、严重程度和预后。皮肤表现也可能在没有呼吸道症状的情况下出现,这对诊断提出了挑战,因为当皮肤表现出现时,受影响患者的呼吸道拭子可能是RNA阴性的。
作为MoRoNet(意大利麻疹和风疹参考实验室网络)认可和WHO认可的伦巴第地区麻疹和风疹监测地方参考实验室,研究人员每年都会收到来自出现麻疹样皮疹的患者的口咽拭子和/或尿液进行检测分子和血清学诊断。
在新冠爆发前的年,意大利麻疹和风疹疑似病例是前两年平均水平的两倍。此外,疑似麻疹和风疹病例的比例稳步上升,从第一次大流行开始时的30%左右上升到70%,到上升到%,提示这些皮肤表现背后发生了系统性病因改变。这些反常数据引起了科学家们的注意。
这些观察促使科学家们调查SARS-CoV-2感染是否可能与麻疹样临床表现有关,从而解释了在意大利观察到第一例已知COVID-19病例数月前开始的流行病学趋势。
近日,一项研究扩展了之前的研究报告,并描述了从COVID-19大流行开始前一年多开始,两年半收集的样本进行的监测结果。同时调查了SARS-CoV-2与麻疹样综合征之间的关联,并为伦巴第大区未被发现的SARS-CoV-2早期传播提供了进一步的证据。
研究人员通过评估了SARS-CoV-2感染与麻疹样综合征之间的关联,为未检测到的SARS-CoV-2早期传播提供了初步证据。
总体而言,调查了来自个病例的个样本。用四个半巢式PCR筛选来自口咽拭子(N=)和尿液(N=)的RNA,并在13名受试者中发现了SARS-CoV-2感染的分子证据。其中两名阳性患者来自大流行期(2/12,16.7%,年3月至年3月),11名来自大流行前时期(11/44,25%,年8月至年2月)。
对血清(N=)进行了抗SARS-CoV-2IgG、IgM和IgA抗体检测。其中五个RNA阳性个体也具有可检测到的抗SARS-CoV-2抗体。在年8月至年7月期间从名患者收集的样本中,没有发现强有力的感染证据。最早有SARS-CoV-2RNA证据的样本来自年9月12日,阳性患者的抗SARS-CoV-2抗体(IgG和IgM)也呈阳性。早在年10月在伦巴第大区收集的样本中就发现了先前报道于年1月出现的B.1菌株的典型突变(CT、CT和AG)。在从公共数据库下载的序列中也发现了其中一个突变(CT),这些序列是其他人从年11月在巴西收集的样本中获得的。
最终得出结论,能够产生麻疹样综合征的SARS-CoV-2祖细胞可能具有于年6月下旬至7月下旬出现,具有B.1毒株特征的突变病毒可能在武汉首次爆发之前已经在全球传播。
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