荧光显微镜是免疫荧光细胞化学的基本工具。它是由光源、滤板系统和光学系统等主要部件组成。采用普通光学显微镜观察。玻片标本通常为苏木素—伊红染色，有时采用特殊染色。
光学显微镜制片首先要尽量保持生物材料的天然状态，避免赝像、变形和失真，因此须将生物材料做固定处理；制片必须薄而透明，才能在光学显微镜下成像，除将材料切成薄片或通过轻压或其他手段使之分散外，还需采用其他方法使它透明和染色，以便更好地观察到结构的细节
实际上所有的生物学材料通过石蜡包埋、切片(或涂片)、贴附、溶蜡、透明等过程，能够得到在厚度和透明度上符各要求的标本，然后通过染色程序得到一定程度的反差。
生物切片经常粘贴在具有26x76mm标准尺寸和1.1^-1.3mm厚度的载玻片上，载玻片的两面应是平行平面。对于载玻件厚度的要求不是很严格的，但是当它的厚度超过一些较高矫正程度集光器的自由工作距离时，载玻片厚度对于聚焦光源以及在物体平面上形成视场光阑的像就变得重要了。对于这种情况，厚度为0.9^-1.0mm的载玻片是比较合适的。
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